一、基本信息

彭文舫，博士，副教授，硕士研究生导师，2017年湖北省省级人才项目获得者

电子邮件：wenfang(at)hubu.edu.cn

研究领域：微生物遗传学、CRISPR-Cas病毒免疫机制、基因编辑

二、教育背景

2012.07–2015.03丹麦哥本哈根大学，理学博士

2010.09–2015.06华中农业大学，理学博士

2005.09–2008.07中国农业科学院，农学硕士

2001.09–2005.07长江大学，农学学士

三、工作经历

2017.07至今 williamhill威廉希尔，副教授

2015.11–2017.06 williamhill威廉希尔，讲师

2008.08–2010.08 中国农业科学院油料作物研究所，研究助理

四、科研/教改项目

（一）主持项目

1.williamhill官网教学建设项目（2020C01）：微生物遗传学（双语）精品课程，在研

2.湖北省人才计划专项经费（2017–2022），负责人

3.湖北省自然科学基金面上项目（2017CFB538），基于嗜热古菌冰岛硫化叶菌CRISPR-Cas系统的DNA/RNA编辑平台的搭建和优化，结题

4.湖北省教育厅青年人才项目（Q20161007），利用酵母内质网滞留系统促进人凝血因子IX（FIX）高活性表达的研究，结题

5.williamhill官网青年科学基金，冰岛硫化叶菌多个CRISPR-Cas系统病毒免疫协作机制，结题

（二）参与项目

1.国家自然科学基金面上项目（31870057），酿酒酵母内质网滞留信号介导的蛋白质滞留效应研究，在研

2.丹麦独立研究（自然科学类）基金项目（DFF-1323-00330），Functional analyses of archaeal Cas/Cmr modules and their integration and cooperation in antiviral defense，258万丹麦克朗，结题

3.国家自然科学基金海外及港澳学者合作研究基金（31128011），极端嗜热古菌CRISPR/Cas系统的功能研究，结题

4.国家自然科学基金面上项目（30471062），花生种子贮藏蛋白在抗黄曲霉产毒中的作用与遗传分化，结题

5.国家自然科学基金面上项目（30571132），中国花生核心种质的构建及重要新基因源发掘，结题

五、发表论文（#共同第一作者，*通讯作者）

（一）第一或通讯作者科研论文

1.Li J.#, Wang B.#, Yang Q., Si H., Zhao Y., Zheng Y.*,Peng W.*(2022). Enabling efficient genetic manipulation in a rare actinomycete Pseudonocardia alni Shahu.Frontiers in Microbiology.13: 848964.

2.Hao Y., Wang Q., Li J., Yang S., Zheng Y.*,PengW.*(2022). Double nicking by RNA-directed Cascade-nCas3 for high-efficiency large-scale genome engineering.Open Biology. 12(1): 210241.

3.HuX.#,LiuH.#,LiJ.,WangJ.,PengW.*(2021). Protein macrocyclization by a recombinant asparaginyl endopeptidase.Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 53(11): 1567–1570.

4.Zheng Y., Li J., Wang B., Han J., Hao Y., Wang S., Ma X., Yang S., Ma L., Yi L.*,Peng W.*(2020). Endogenous Type I CRISPR-Cas: From Foreign DNA Defense to Prokaryotic Engineering.Frontiers in Bioengineering & Biotechnology.8: 62.

5.Zheng Y., Han J., Wang B., Hu X., Li R., Shen W., Ma X., Ma L., Yi L.*, Yang S.*,Peng W.*(2019). Characterization and repurposing of the endogenous Type I–F CRISPR–Cas system of Zymomonas mobilis for genome engineering.Nucleic Acids Research47(21): 11461–11475.

6.Peng W., Feng M., Feng X., Liang Y. X., She Q.*(2015). An archaeal CRISPR type III–B system exhibiting distinctive RNA targeting features and mediating dual RNA and DNA interference.Nucleic Acids Research43(1): 406-417.

7.Peng W., Li H., Hallstrom S., Peng N., Liang Y. X., She Q.*(2013). Genetic determinants of PAM–dependent DNA targeting and pre-crRNA processing in Sulfolobus islandicus.RNA Biology10(5): 738–748.

（二）合作作者科研论文

1.Xie X.-H.,FuX.,YanX.-Y.,PengW.-F.,KangL.-X.*(2021). A broad-specificy chitinase from Penicillium oxalicum k10 exhibits antifungal activity and biodegradation properties of chitin.Marine Drugs.19: 356.

2.Lv Y.#, Jiang Y.#,Peng W., Fang Y., Dong W., Zhou J., Xin F.*, Zhang W.*Jiang M.*(2021). Genetic manipulation of non-solvent-producing microbial species for effective butanol production.Biofuels, Bioproducts & Biorefining.15(3): 119–130.

3.Guo F.#, Dai Z.#,Peng W., Zhang S., Zhou J., Ma J., Dong W., Zhou J., Xin F.*, Zhang W.*Jiang M.* (2021). Metabolic engineering of Pichia pastoris for malic acid production from methanol.Biotechnology & Bioengineering.118(1): 357–371.

4.Lu J.,Peng W., Lv Y., Jiang Y., Xu B., Zhang W., Zhou J., Dong W., Xin F.*, Jiang M.*(2020). Application of cell immobilization technology in microbial cocultivation systems for biochemicals production.Industrial & Engineering Chemistry Research59:17026–17034.

5.Shen W., Zhang J., Geng B., Qiu M., Hu M., Yang Q., Bao W., Xiao Y., Zheng Y.,Peng W., Zhang G., Ma l., Yang S.*(2019). Establishment and application of a CRISPR-Cas12a assisted genome–editing system in Zymomonas mobilis.Microbial Cell Factory18: 162.

6.Fan X., Li X., Zhou Y., Mei M., Liu P., Zhao J.,Peng W., Jiang Z.-B., Yang S., Iverson B. L., Zhang G.*, Yi L.*(2019). Quantitative Analysis of the Substrate Specificity of Human Rhinovirus 3C Protease and Exploration of Its Substrate Recognition Mechanisms.ACS Chemical Biology15:63–73.

7.Han W.#, Li Y.#, Deng L., Feng M.,Peng W.,Hallstrom S., Zhang J., Peng N., Liang Y. X., White M. F. White, She Q.*(2017). A type III-B CRISPR-Cas effector complex mediating massive target DNA destruction.Nucleic Acids Research45(4): 1983–1993.

8.He F., Vestergaard G.,Peng W., She Q., Peng X.*(2017). CRISPR-Cas type I-A Cascade complex couples viral infection surveillance to host transcriptional regulation in the dependence of Csa3b.Nucleic Acids Research45(4): 1902–1913.

9.Liu T., Liu Z., Ye Q., Pan S., Qang X.,Peng W., Li Y., Liang Y. X., She Q., Peng N.*(2017). Coupling transcriptional activation of CRISPR-Cas system and DNA repair genes by Csa3a in Sulfolobus islandicus.Nucleic Acids Research, 45(15): 8978–8992.

10.Mei M., Zhou Y.,Peng W., Yu C., Ma L., Zhang G.*, Yi L.*(2017). Application of modified yeast surface display technologies for non–antibody protein engineering.Microbiological Research196: 118–128.

11.Mei M., Zhai C., Li X., Zhou Y.,Peng W., Ma L., Wang Q., Iverson B. L., Zhang G.*, Yi L.*(2017). Characterization of aromatic residue-controlled protein retention in the endoplasmic reticulum of Saccharomyces cerevisiae.Journal of Biological Chemistry, 292(50): 20707–20719.

12.Garrett R. A.*, Shah S. A., Erdmann S., Liu G., Mousaei M., Leon-Sobrino C.,Peng W., Gudbergsdottir S., Deng L., Vestergaard G., Peng X., She Q. (2015). CRISPR-Cas adaptive immune systems of the Sulfolobales: Unravelling their complexity and diversity.Life (Basel)5(1): 783–817.

六、授权专利

（一）第一发明人

1.彭文舫，郝怡乐（2022）一种基于CRISPR-nCas3系统的高效基因组大片段删除方法及应用（ZL202110639401.1）

2.彭文舫，郝怡乐（2022）一种含nCas3单链核酸酶切酶的工程菌、制备方法及应用（ZL202110639403.0）

3.彭文舫，郝怡乐（2022）一种nCas3单链核酸酶切酶及其应用（ZL202110638175.5）

4.彭文舫，杨世辉，郑艳丽，易犁，马立新（2021）基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的基因组大片段高效删除方法及其应用（ZL201910692120.5）

5.彭文舫，杨世辉，郑艳丽，易犁，马立新（2021）基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的多基因位点同时编辑方法及其应用（ZL201910692118.8）

6.彭文舫，胡晓韵，易犁，范贤，马立新（2021）一种AEP环化酶在毕赤酵母中的表达方法及其应用（ZL201910712032.7）

7.彭文舫，胡晓韵，易犁，范贤，马立新（2021）一种AEP环化酶在大肠杆菌中的融合表达方法、AEP环化酶环化能力鉴定方法及其应用（ZL201910712666.2）

（二）非第一排名发明人

1.杨世辉，彭文舫，郑艳丽，易犁，马立新（2021）一种基于运动发酵单胞菌內源CRISPR-Cas系统的基因编辑方法及其应用（ZL201910692143.6）

2.杨世辉，沈威，彭文舫，马立新（2021）一种基于CRISPR–Cas12a系统的运动发酵单胞菌基因编辑方法及其应用（ZL201910692112.0）

3.张桂敏，卢争辉，袁芯，彭文舫，石云云，蒋思婧，马延和（2021）一种特异性调节枯草芽孢杆菌外源基因表达的dcas9–ω融合蛋白及其应用.（ZL201710965231.X）

4.杨世辉，彭文舫，沈威，郑艳丽，易犁，马立新（2021）一种基于运动发酵单胞菌的CRISPR–Cas系统、基因组编辑体系及其应用（PCT/CN2019/112556）

5.易犁，范贤，彭文舫，周瑜，喻婵，张桂敏（2020）一种切割效率增强的HRV 3C蛋白酶底物突变体及其应用.（ZL201710956966.6）

6.易犁，周瑜，张桂敏，彭文舫，马立新，马延和(2020)一组不同启动子介导的蛋白酶高通量筛选载体及筛选方法（ZL201510802312.9）